Defensa de Tesis: 'BIOMETA: Procedimientos bioinformáticos para el avance de la implementación de la metagenómica clínica'

La metagenómica clínica es un campo emergente que permite la identificación de microbios y facilita el diagnóstico de condiciones patológicas, proporcionando una comprensión más matizada del comportamiento del microbioma. Actualmente, la secuenciación del rRNA 16S es el método más utilizado para identificar bacterias y arqueas.

En esta tesis, nos centramos en el desarrollo de dos procedimientos bioinformáticos y una base de datos con el objetivo de mejorar nuestra comprensión del microbioma. Los procedimientos incluyen la evaluación de cebadores o pares de cebadores, y la clasificación de fenotipos mediante un pipeline basado en ensamblajes de aprendizaje automático. La base de datos recopila los números de copias del gen 16S rRNA presentes en genomas bacterianos y arqueales completos. Aunque estudiamos principalmente datos del microbioma oral, los procedimientos desarrollados pueden usarse para estudiar cualquier microbioma.

• Directoras: María José Carreira Nouche e Inmaculada Tomás Carmona.