Defensa de Tese: 'BIOMETA: Procedementos bioinformáticos para o avance da implementación da metaxenómica clínica'

A metaxenómica clínica é un campo emerxente que permite a identificación de microbios e facilita o diagnóstico de condicións patolóxicas, proporcionando unha comprensión máis matizada do comportamento do microbioma. Actualmente, a secuenciación do rRNA 16S é ou método máis utilizado para identificar bacterias e arquexas.

Nesta tese, centrámonos no desenvolvemento de dous procedementos bioinformáticos e unha base de datos co obxectivo de mellorar a nosa comprensión do microbioma. Os procedementos inclúen a avaliación de cebadores ou pares de cebadores, e a clasificación de fenotipos mediante un pipeline baseado en ensamblaxes de aprendizaxe automática. A base de datos recompila os números de copias do xene 16S rRNA presentes en xenomas bacterianos e arqueais completos. Aínda que estudamos principalmente datos do microbioma oral, os procedementos desenvolvidos poden usarse para estudar calquera microbioma.

• Directoras: María José Carreira Nouche e Inmaculada Tomás Carmona.