Nuevos biomarcadores bacterianos, actividades funcionales, cambios dinámicos e interacciones bacterianas en la enfermedad periodontal crónica
El proxecto se desarrolla mediante la colaboración entre el Oral Science Research Group y miembros del Grupo de Visión Artificial del CiTIUS, ambos pertenecientes asimismo al IDIS. La finalidad del proyecto es analizar, desde un punto metatranscriptómico y metagenómico con carácter longitudinal, el microbioma oral asociado a la periodontitis crónica, evaluando nuevos biomarcadores bacterianos, su actividad funcional, así como los cambios dinámicos acontecidos después de un tratamiento periodontal convencional sobre el ecosistema oral. También se realizará una aproximación al análisis de las interacciones microbianas. Esto permitirá profundizar en el entendimiento de la patogénesis de esta disbiosis polimicrobiana, esclarecer el potencial del microbioma oral (de especies específicas y consorcios bacterianos) como indicador diagnóstico/pronóstico de la periodontitis crónica, y contribuir a la búsqueda de nuevas terapias y modalidades de tratamiento.
Objetivos
Sobre las muestras clínicas de placa subgingival se plantea identificar el repertorio genético global del microbioma subgingival en la salud y en la periodontitis crónica, proponiéndose los siguientes objetivos específicos:
1) Analizar y comparar los procesos biológicos y mecanismos funcionales (clases funcionales y módulos/rutas metabólicas) y la composición de los microbiomas orales asociados a la salud y a la periodontitis crónica.
2) Analizar y comparar las variaciones genéticas específicas y los factores de virulencia de los principales patobiontes y simbiontes en los microbiomas orales en la salud y la periodontitis crónica.
3) Analizar y comparar los cambios dinámicos funcionales/composicionales de los microbiomas orales en la periodontitis, antes y después de la práctica de un tratamiento periodontal básico no-quirúrgico.
4) Determinar la existencia de subcomunidades bacterianas asociadas a la salud oral y a la periodontitis crónica no tratada y tratada.
5) Determinar consorcios bacterianos formados por taxones que interactúan y que representan unidades centrales de la comunidad bacteriana global.
6) Explorar in silico la funcionalidad y estabilidad metabólica de especies específicas y de pequeños consorcios bacterianos en distintas condiciones clínicas.
7) Desarrollar un software específico con una interface web para facilitar el proceso bioinformático de análisis de comunidades polimicrobianas.
Proyecto
/research/projects/novos-biomarcadores-bacterianos-actividades-funcionais-cambios-dinamicos-e-interacions-bacterianas-na-enfermidade-periodontal-cronica
<p>El proxecto se desarrolla mediante la colaboración entre el Oral Science Research Group y miembros del Grupo de Visión Artificial del CiTIUS, ambos pertenecientes asimismo al IDIS. La finalidad del proyecto es analizar, desde un punto metatranscriptómico y metagenómico con carácter longitudinal, el microbioma oral asociado a la periodontitis crónica, evaluando nuevos biomarcadores bacterianos, su actividad funcional, así como los cambios dinámicos acontecidos después de un tratamiento periodontal convencional sobre el ecosistema oral. También se realizará una aproximación al análisis de las interacciones microbianas. Esto permitirá profundizar en el entendimiento de la patogénesis de esta disbiosis polimicrobiana, esclarecer el potencial del microbioma oral (de especies específicas y consorcios bacterianos) como indicador diagnóstico/pronóstico de la periodontitis crónica, y contribuir a la búsqueda de nuevas terapias y modalidades de tratamiento.</p> <p> </p><p>Sobre las muestras clínicas de placa subgingival se plantea identificar el repertorio genético global del microbioma subgingival en la salud y en la periodontitis crónica, proponiéndose los siguientes objetivos específicos:<br />1) Analizar y comparar los procesos biológicos y mecanismos funcionales (clases funcionales y módulos/rutas metabólicas) y la composición de los microbiomas orales asociados a la salud y a la periodontitis crónica.<br />2) Analizar y comparar las variaciones genéticas específicas y los factores de virulencia de los principales patobiontes y simbiontes en los microbiomas orales en la salud y la periodontitis crónica.<br />3) Analizar y comparar los cambios dinámicos funcionales/composicionales de los microbiomas orales en la periodontitis, antes y después de la práctica de un tratamiento periodontal básico no-quirúrgico.<br />4) Determinar la existencia de subcomunidades bacterianas asociadas a la salud oral y a la periodontitis crónica no tratada y tratada. <br />5) Determinar consorcios bacterianos formados por taxones que interactúan y que representan unidades centrales de la comunidad bacteriana global. <br />6) Explorar in silico la funcionalidad y estabilidad metabólica de especies específicas y de pequeños consorcios bacterianos en distintas condiciones clínicas.<br />7) Desarrollar un software específico con una interface web para facilitar el proceso bioinformático de análisis de comunidades polimicrobianas.</p> - María José Carreira Nouche, Nicolás Vila Blanco
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