DenTiUS Biofilm

Caja de herramientas de Matlab para calcular la vitalidad bacteriana en biofilm oral in situ

Dentius_Biofilm es una caja de herramientas para calcular la viabilidad bacteriana del biofilm oral in situ

Autora: Maria J. Carreira (CiTIUS, USC)

Colaboradores: Inmaculada Tomás, Carlos Balsa-Castro (Grupo de Investigación en Ciencias Orales, USC), Nicolás Vila-Blanco

Artículo de referencia en el que se utiliza la caja de herramientas: Quintas V, Prada-López I, Carreira MJ, Suárez-Quintanilla D, Balsa-Castro C y Tomás I: In Situ Actividad antibacteriana de los aceites esenciales, con y sin alcohol, sobre el biofilm oral: un ensayo clínico aleatorizado. Front. Microbiol. 8:2162. doi: 10.3 Frontiers in Microbiology, vol. noviembre de 2017, n.º 23. 2017

Se han llevado a cabo diferentes objetivos mediante la aplicación de esta caja de herramientas. En primer lugar, comparar la viabilidad bacteriana del biofilm oral in situ con diferentes tipos de antisépticos (clorhexidina, aceites esenciales con alcohol y aceites esenciales sin alcohol). En segundo lugar, comparar la viabilidad bacteriana de un biofilm in situ formado sobre un sustrato artificial con la de un biofilm formado in situ sobre los dientes por encima de la encía en los mismos individuos, así como el impacto de la posición del dispositivo/disco intraoral y del cepillado dental durante la formación del biofilm.

Los voluntarios llevan un modelo dividido IDODS (férulas intraorales para la sujeción de discos superpuestos), con varios discos y campos, para medir la viabilidad de las bacterias en el biofilm acumulado in situ.

Las imágenes se adquieren mediante microscopía confocal, tras teñir las muestras de biofilm con la solución LIVE/DEAD® BacLight™.

Para cada paciente con IDODS (férulas intraorales para la sujeción de discos superpuestos):

  • número de discos (diferentes lugares de la IDODS a lo largo de la arcada dental)
  • número de campos de 1 micrómetro de grosor
  • número de capas en el eje z de la microscopía confocal

Dentius_Biofilm calcula automáticamente la viabilidad bacteriana de cada paciente en cada experimento, aunque cada paciente tenga un número diferente de discos/campos/capas. Funciona con la información de la jerarquía de carpetas.

Dentius_Biofilm elimina automáticamente del cálculo los píxeles no viables pertenecientes a los núcleos de células epiteliales

Dentius_Biofilm guarda todos los resultados de viabilidad (considerando o no los núcleos de células epiteliales) en una hoja de cálculo llamada EE_results.xlsx. También guarda el número y las propiedades de los núcleos de células endoteliales.