Fish Ovary
Características de textura de imaxes histolóxicas de ovario de peixe
Cada cartafol que comeza por oocytes_ contén un conxunto de datos. Consulta o ficheiro README.md de cada cartafol para obter máis información sobre cada un deles.
Os datos están nos ficheiros XX_R.dat (p. ex. oocytes_merluccius_states_2f_R.dat). Estes datos son características de textura de ovocitos extraídos de imaxes histolóxicas de ovarios de peixes das especies Merluccius e Trisopterus. Hai 4 conxuntos de datos (cada un corresponde a unha combinación diferente de características de textura, tal como se describe na referencia seguinte):
ConxuntoInstanciasEntradasClasesMerluccius Estados1022253Merluccius Núcleo1022412Trisopterus Estados912253Trisopterus Núcleo912252Os valores de cada entrada están estandarizados cunha media igual a cero e unha desviación estándar igual a un. As clases dos conxuntos de datos dos estados de Merluccius e Trisopterus son ordinais; é dicir, hai unha orde da clase 0 á clase 1 e da clase 1 á clase 2, xa que as tres clases representan estados de desenvolvemento dos ovocitos. Polo tanto, estes dous conxuntos de datos son problemas de clasificación ordinal.
Os cartafoles que comezan por reinhardtius_ conteñen datos da especie Reinhardtius hippoglossoides con seis estados de desenvolvemento: crecemento primario (pg), alvéolos corticais (ac), vit1 (subnivel viteloxenético #1), vit2 (subnivel viteloxenético #2), vit3 e vit4: o ficheiro reinhardtius_hippoglossoides-leave-one-image-out.tar.gz ten 16 directorios, cada un cos conxuntos de adestramento, validación e proba dunha das 16 imaxes desta especie, usando unha validación Leave-One-Image-Out; é dicir, no ensaio i-ésimo, os conxuntos de adestramento e validación conteñen patróns de todas as imaxes agás a i-ésima, e o conxunto de proba contén patróns da i-ésima imaxe.
O ficheiro reinhardtius_hippoglossoides-mixed-images.tar.gz contén 10 directorios, cada un cun ficheiro de adestramento, validación e proba: os tres ficheiros conteñen patróns das 16 imaxes, co fin de realizar unha validación cruzada de 10 particións. Todos os patróns teñen 25 entradas: as 10 primeiras son características de textura en niveis de gris (patróns binarios locais); as últimas 15 son características cromáticas. A táboa seguinte especifica as instancias e o número de patróns de cada clase para cada imaxe
Cita recomendada
@article{rufino13,
author="{E. Gonz\'alez-Rufino and P. Carri\'on and E. Cernadas and M. Fern\'andez-Delgado and R. Dom\'inguez-Petit}",
journal={Pattern Recognition},
pages = {2391—2407},
title = "{Exhaustive comparison of colour texture features and classification methods to discriminate cells categories in histological images of fish ovary}",
volume = {46},
year = {2013},
}
@article{perez15,
author="{M. P\'erez-Ortiz and M. Fern\'andez-Delgado and E. Cernadas and R. Dom\'inguez-Petit and P.A. Guti\'errez and C. Herv\'as-Mart\'inez}",
journal={Neural Processing Letters},
title = "{On the use of nominal and ordinal classifiers for the discrimination of states of development in fish oocytes}",
pages = {1--16},
url={http://dx.doi.org/10.1007/s11063-015-9476-8},
doi = {10.1007/s11063-015-9476-8},
issn="1573-773X",
}