BreastAnalyser

Problema

El cáncer de mama es el cáncer más diagnosticado en todo el mundo y representa la quinta causa de mortalidad por cáncer a nivel mundial. Es una enfermedad muy heterogénea que comprende diversos subtipos moleculares, a menudo diagnosticados mediante inmunohistoquímica (IHQ) basada en 3,3'-diaminobencidina tetrahidrocloruro (DAB), un procedimiento que tiñe de marrón antígenos proteicos específicos. La IHQ es una técnica muy utilizada en la investigación básica, traslacional y de anatomía patológica, donde puede contribuir al diagnóstico oncológico, a las decisiones terapéuticas y al descubrimiento de biomarcadores. No obstante, su evaluación suele ser (semi)cualitativa. El análisis automático de imágenes microscópicas de patología es especialmente complejo debido a la gran variabilidad entre pacientes, estrechamente relacionada con la elevada complejidad del cáncer de mama y con la complejidad inherente de las imágenes patológicas, debida a las diferencias en el procesamiento de los tejidos, la tinción, la adquisición de imágenes... En consecuencia, crece la demanda de métodos más fieles y fiables para la cuantificación de la IHQ; el análisis de imágenes asistido por ordenador permite obtener mayor precisión, robustez y calidad para este fin.

Solución propuesta: BreastAnalyser

BreastAnalyser es un programa con una interfaz gráfica sencilla que permite cuantificar imágenes inmunohistoquímicas de cáncer de mama humano. Este programa incluye sofisticados algoritmos de segmentación que no solo miden automáticamente el área de las proteínas teñidas de marrón por la DAB detectadas mediante IHQ, sino que también cuentan automáticamente los núcleos celulares y los clasifican según su nivel de tinción marrón por la DAB. Además, permite la supervisión posterior de todas las cuantificaciones realizadas por parte del usuario final y ofrece una interfaz clara, sencilla e intuitiva, que también puede utilizarse para anotar imágenes o unificar los criterios de los expertos. BreastAnalyser es lo suficientemente rápido como para funcionar en línea en un ordenador personal de uso general en cualquier laboratorio biomédico.

Las herramientas de software actualmente disponibles para este fin suelen requerir ciertos conocimientos de programación o scripting, ajustes minuciosos y lentos del preprocesamiento de imágenes, formación exhaustiva en el uso del software con imágenes de muestra, ausencia o escasa supervisión posterior de la cuantificación automática o incluso dispositivos específicos y costosos de digitalización microscópica. BreastAnalyser ofrece una alternativa más directa y fiable, que supera estas limitaciones en términos de simplicidad y pragmatismo al proporcionar una forma sencilla y rápida de revisar el reconocimiento automático de objetos en las imágenes.

El programa BreastAnalyser puede contribuir eficazmente tanto a la investigación básica como a la traslacional. También podría ser ventajoso para determinadas tareas de anatomía patológica, en particular para automatizar la cuantificación de la señal marrón de la IHQ, y constituye una posible herramienta clínica para el diagnóstico y el pronóstico del cáncer de mama.