BreastAnalyser

Problema

O cancro de mama é o cancro máis diagnosticado a nivel mundial e representa a quinta causa de mortalidade por cancro no mundo. É unha enfermidade altamente heteroxénea que comprende diversos subtipos moleculares, diagnosticados a miúdo mediante inmunohistoquímica (IHQ) baseada en 3,3'-diaminobencidina tetrahidrocloruro (DAB), un procedemento que tinxe de marrón antíxenos proteicos específicos. A IHQ é unha técnica moi empregada na investigación básica, translacional e de anatomía patolóxica, onde pode apoiar o diagnóstico oncolóxico, as decisións terapéuticas e o descubrimento de biomarcadores. Non obstante, a súa avaliación adoita ser (semi)cuantitativa. A análise automática de imaxes microscópicas de patoloxía é especialmente complexa debido á ampla variabilidade entre pacientes, estreitamente relacionada coa elevada complexidade do cancro de mama e coa complexidade inherente das imaxes patolóxicas, que se debe ás diferenzas no procesamento dos tecidos, na tinguidura, na adquisición de imaxes... Por conseguinte, medra a demanda de métodos máis fieis e fiables para a cuantificación da IHQ; a análise de imaxes asistida por ordenador permite acadar maior precisión, robustez e calidade para este fin.

Solución proposta: BreastAnalyser

BreastAnalyser é un programa cunha interface gráfica sinxela que permite cuantificar imaxes inmunohistoquímicas de cancro de mama humano. Este programa inclúe algoritmos de segmentación sofisticados que non só miden automaticamente a área das proteínas tinguidas de marrón pola DAB detectadas mediante IHQ, senón que tamén contan automaticamente os núcleos celulares e os clasifican segundo o seu nivel de tinguidura marrón pola DAB. Ademais, permite a supervisión posterior de todas as cuantificacións realizadas por parte do usuario final, cunha interface clara, sinxela e intuitiva, que tamén se pode empregar para anotar imaxes ou unificar os criterios dos expertos. BreastAnalyser é suficientemente rápido para traballar en liña nun ordenador persoal de uso xeral en calquera laboratorio biomédico.

As ferramentas de software dispoñibles actualmente para este fin adoitan esixir certos coñecementos de programación ou scripting, axustes minuciosos e lentos do preprocesamento das imaxes, formación exhaustiva do software con imaxes de mostra, ausencia ou escasa supervisión posterior da cuantificación automática ou mesmo dispositivos específicos e custosos de dixitalización microscópica. BreastAnalyser ofrece unha alternativa máis directa e fiable, que supera estas limitacións en termos de simplicidade e pragmatismo ao proporcionar unha forma sinxela e rápida de revisar o recoñecemento automático dos obxectos nas imaxes.

O programa BreastAnalyser pode apoiar eficazmente tanto a investigación básica como a translacional. Tamén podería ser vantaxoso para determinadas tarefas de anatomía patolóxica, nomeadamente a automatización da cuantificación do sinal marrón da IHQ, e constitúe unha posible ferramenta clínica para o diagnóstico e o prognóstico do cancro de mama.