CystAnalyser

Problema

La enfermedad renal poliquística (PKD) se caracteriza por el desarrollo progresivo de quistes renales y otras manifestaciones extrarrenales, como la enfermedad hepática poliquística (PLD). La caracterización fenotípica de modelos animales que reproducen enfermedades humanas es una práctica habitual en la comunidad científica para estudiar nuevos mecanismos moleculares e identificar posibles nuevos enfoques terapéuticos. El principal biomarcador de la progresión de la enfermedad es el volumen total del riñón y el hígado, tanto en humanos como en ratones, que se correlaciona con la función de los órganos. Por este motivo, la estimación del número de quistes y del área que ocupan es fundamental para comprender los mecanismos fisiológicos subyacentes a la enfermedad. En este sentido, el índice quístico es un parámetro robusto que se utiliza habitualmente para cuantificar la gravedad de la enfermedad.

Hasta la fecha, la gran mayoría de los investigadores biomédicos utilizan ImageJ como herramienta de software para estimar el índice quístico mediante la cuantificación de las áreas quísticas en imágenes histológicas después de aplicar un umbral. Esta herramienta tiene la limitación de ser poco precisa, debido a la identificación inespecífica de regiones no quísticas (regiones blancas de la imagen), que se contabilizan erróneamente como áreas quísticas.

Solución propuesta: CystAnalyser

CystAnalyser es una herramienta de software para la detección y cuantificación automáticas de quistes en la enfermedad renal y hepática poliquística, así como en otros trastornos quísticos. Combina el procesamiento automático de imágenes con una interfaz gráfica de usuario (GUI) fácil de usar, que permite a los investigadores supervisar y corregir fácilmente el procesamiento de imágenes antes de la cuantificación. CystAnalyser puede proporcionar a los usuarios el índice quístico, el número de quistes y el perfil de tamaños de los quistes.

CystAnalyser es lo suficientemente rápido como para funcionar en línea en un ordenador personal de uso general en cualquier laboratorio biomédico (el análisis automático tarda aproximadamente 3 segundos por imagen). Si se necesita la supervisión de un experto, tarda menos de 3 minutos.

Vídeo de demostración

Ventajas de CystAnalyzer frente a ImageJ

• Proporciona más información: el número de quistes en las imágenes y el perfil quístico (basado en el tamaño individual de cada quiste)
• Permite a los expertos supervisar el proceso de cuantificación predeterminado para obtener resultados con mayor precisión y robustez.
• CystAnalyser supera a ImageJ en precisión y fiabilidad, y es menos subjetivo incluso sin supervisión del usuario.