STERapp
Una herramienta gráfica fácil de usar para realizar análisis estereológicos
Problema
La estereología es un conjunto de técnicas y metodologías para estimar parámetros geométricos cuantitativos no sesgados (por ejemplo, número, longitud, área y volumen) a partir de material sólido, basándose en la relación entre una estructura 3D y las secciones transversales 2D obtenidas de ella; es decir, la estereología es la interpretación tridimensional de las secciones bidimensionales de una estructura.
La fecundidad es un parámetro clave en el estudio de la biología de las poblaciones de peces y su dinámica. Su estimación se utiliza para calcular la productividad de las poblaciones de peces, así como la biomasa reproductora, mediante la aplicación de métodos de producción de huevos (EPM), con el fin de establecer puntos de referencia biológicos que se utilizan para la gestión sostenible de las pesquerías. Estimar la fecundidad mediante métodos estereológicos implica contar y medir los diámetros de los ovocitos (células esféricas) en diferentes fases de desarrollo (alvéolos corticales, vitelogénicos e hidratados), así como de las células que serán reabsorbidas (atrésicas), en imágenes histológicas. Para medir el diámetro, solo deben considerarse aquellos ovocitos con el núcleo visible en la preparación histológica (es decir, cortados cerca de su diámetro máximo). Aunque la estereología es un método robusto y no sesgado para estimar la fecundidad, sigue requiriendo técnicos especializados y lleva mucho tiempo, incluso con el software disponible en la actualidad.
Solución propuesta: STERapp
STERapp es un software de uso general para realizar análisis estereológicos con una interfaz gráfica intuitiva que permite la supervisión de personas expertas. Incluye un módulo para estimar la fecundidad de los peces (número y tamaño de los ovocitos maduros en el ovario), que están utilizando especialistas en biología de peces de dos centros españoles de investigación marina, los laboratorios IIM-CSIC e IEO-Vigo, para estimar la fecundidad de especies de peces con diferentes estrategias reproductivas y características de los ovocitos.
El tiempo que necesitan las personas expertas para procesar imágenes histológicas con STERapp es mucho menor que con otras herramientas, porque su interfaz gráfica de usuario (GUI), intuitiva y fácil de usar, facilita mucho el trabajo técnico. STERapp es lo suficientemente rápido para trabajar en línea en un ordenador personal de propósito general en cualquier laboratorio biológico.